Капитан ВВС США Колтер Стивенс просыпается в электричке на подъезде к Чикаго, что странно, так как вообще-то он находится в Афганистане. Незнакомая барышня с улыбкой называет его Шон, в кармане чужое удостоверение личности, а в зеркале отражается незнакомое лицо. Ошарашенный Колтер не успевает понять, в чем дело - через 8 минут поезд взрывается. И капитан опять просыпается - на этот раз в своем теле, но в очень странном месте. Место называется "Исходный код" - это программа, которая позволяет перемещать сознание в тела других людей за несколько минут до их смерти. Оказывается, Стивенс на задании - ему нужно узнать, кто взорвал состав. И вот он снова просыпается на подъезде к Чикаго...